Las autoridades de la Facultad son las personas que ocupan el decanato. Tras las elecciones de octubre del 2021 la comunidad de la FCQ eligió al Dr. Marcelo Mariscal como Decano y a la vicedecana Dra. Silvia Correa, quienes asumieron sus funciones el 1º de diciembre de 2021.
Históricamente las autoridades universitarias se renuevan cada tres años, mediante el voto directo de toda la comunidad de la Facultad. Pero por decisión mayoritaria de la Asamblea Universitaria, que modificó el Estatuto, el periodo de vigencia de las autoridades decanales actuales se extenderá hasta el 31 de julio de 2025.
La información se encuentra en la Resolución del Ministerio de Educación Nº 1412/2023 mediante la cual se aprueba la reforma de los artículos 16 y 33 del Estatuto respecto de la duración de los mandatos de autoridades rectorales y decanales de la Universidad Nacional de Córdoba (ver Anexo).