| Área: | Bioinformática y Biología Computacional |
| Grupo de Trabajo/Laboratorio: | Simulaciones computacionales de sistemas biológicos |
| Nombre y Apellido: | Marcos Villarreal |
| Cargo docente: | Profesor Adjunto (DS) |
| Categoría CIC CONICET: | Independiente |
| Integrantes: | Rodrigo Quiroga, Profesor Adjunto (DS), Investigador. Martín Ludueña, Profesor Asistente (DS), Investigador. Marcos Villarreal, Profesor Adjunto (DS), Investigador. |
| Descripción: | Resumen de las distintas líneas de investigación en las que trabajamos: 1-Desarrollo de funciones de puntuación para acoplamiento molecular (docking) y cribado virtual (virtual screening). El objetivo general de esta línea de trabajo es desarrollar métodos computacionales que permitan enfrentar los desafíos actuales en el campo de la simulación de interacciones proteína-ligando. Nos proponemos desarrollar métodos novedosos de acoplamiento molecular para la predicción de poses (posición, orientación y conformación) y energías de interacción entre proteínas y ligandos, así como métodos de cribado virtual para la predicción de nuevos activadores/inhibidores de proteínas de interés biológico y médico. Esta línea también implica colaboración con múltiples grupos experimentales, principalmente con la realización de cribados virtuales para confeccionar listas de compuestos con mayor probabilidad de ser inhibidores de ciertas enzimas de interés. 2- Bioinformática y análisis de secuencias. En esta área de trabajo nos dedicamos principalmente a la colaboración con grupos experimentales, realizando predicciones sobre función, estructura, localización subcelular, antigenicidad y sitios catalíticos de distintas enzimas y proteínas. 3- COVID-19. Dada la emergencia de la pandemia, desarrollamos modelos computacionales que permitan evaluar el posible impacto epidemiológico de distintas intervenciones no-farmacéuticas, así como sistemas computacionales de reposicionamiento de drogas para COVID-19. |
| Resumen: | Desarrollamos y aplicamos métodos computacionales para estudiar las interacciones de moléculas pequeñas con proteínas. Simulamos sistemas biológicos, en particular proteínas y sus interaccionas con ligandos, membranas lipídicas y otras proteínas. |
| Contacto: | mvillarreal@unc.edu.ar |
