La Facultad de Ciencias Químicas ofrece tres Maestrías con reconocimiento oficial, con cursado presencial en diferentes modalidades más o menos estructuradas.
Estas carreras son gestionadas por la FCQ o cogestionadas con otras facultades para la formación de recursos humanos con una alta capacitación profesional y destreza en el manejo del método científico.
La Maestría capacita para la integración de equipos de investigación y desarrollo y para la inserción en el sector productivo y/o de servicios.